巨人的穴藏、禁忌的穴倉、藏書的穴倉，有諸多異名、藏匿於埃及阿特拉斯山腳下的阿特拉斯院，就算在神祕的魔術世界中也算是特別神秘的，既沒有像時鐘塔那樣將自己的影響力擴展出去，也沒有像徬徨海一樣拒絕外面的一切，阿特拉斯院就像一塊海綿一般，將世間頭腦超人一等的天才們吸收進來。
其間的中心部是看起來像方尖碑的擬似靈子演算裝置TRI-HERMES，據說阿特拉斯的院長透過這個超級電腦計算出人類滅亡的未來，為了避免這樣的事情發生而持續思考著。
一隻不起眼的黑貓此時站在沒有人的沙地中間，看著TRI-HERMES。
他心裡諷刺地想著，這樣的願望卻打造出七個可能摧毀世界的兵器，「不要解開阿特拉斯的封印，世界可是會被毀滅七次的」，這句話聽起來也真好笑，世界只有一個，當然也就只能毀滅一次，結果也就是在比誰可以更早、更快地毀滅世界而已。
這個除了收藏可以吹噓以外，就沒什麼其他有趣東西的地方，還有幾個戒律：
「自己的研究只對自己公開。」
「在這裡製造的東西，絕不能攜帶出去。」
聽說已經被遵守了兩千年，這些人也太無聊了吧？所謂原則就是用來被打破的，而這些所謂天才們卻從來沒有想過這個念頭，真是沒看過比這裡更無趣的地方。
說是這樣說，其實貓自己一步也沒有踏出過阿特拉斯院，他是主人因為太無聊所做的研究，試著用禮裝輔助哺乳類動物分割與加速思考，看看從不同的生物角度可以觀察到什麼特別的東西。
結果令主人大失所望的是，這隻貓的想法不僅沒有特別的見解，還有一種自以為高人一等的態度。
「嘛。」主人晃著腦袋，拍了拍已經沒有幾根毛髮的額頭：「也不讓人意外就是了。」
不過為了讓貓可以使用這些禮裝，他的主人還為他研究了專屬於貓的魔術刻印，雖然主人根本沒考慮過魔術刻印不相容、貓就死定了的情況，不過從他從容地隨手為一隻不知道哪來的貓做出魔術刻印的情況看來，主人的魔術造詣應該是無庸置疑的，而這個堆滿失敗廢棄物的阿特拉斯院，其中穴藏的豐富程度也可見一斑。
雖然貓的分割思考與運算速度遠遠落後於主人，不過總是聊勝於無，做點打雜跑腿之類的事情還是有些功用，貓也就被當成比較貴的使魔與助手了。
在工作之餘，貓也利用空閒時間自己鑽研魔術，而他很快就遇到第一個障礙：壽命。
人的一生有如過往雲煙，倏忽即逝，貓生更是如此，但幸運的是主人為貓所做魔術刻印的芯才，是印度某佛教高僧得道成佛所坐臥的菩提樹心，似乎帶有輪迴以及記憶的功能，繼承貓魔術刻印的貓，也同樣會繼承貓的魔術與記憶，而且不管繼承的貓原來毛色如何，都會在繼承貓的魔術刻印之後轉黑，就像是原來的黑貓一樣。
「喔？這倒是讓人有些興趣。」主人親眼見證貓的第一次魔術刻印轉移，第一代貓體已經存活將近四十年，在轉移的當下瞬間萎縮、發白、崩解，就像是多年未見天日的古藏那樣，被刨去覆蓋的土層並接觸空氣後瞬間氧化，失去本來的色彩。
就這樣差不多換到第三代時，潛心鑽研自己研究的主人終於shut down了，就像是一台看似高速運轉的電腦，一切情況正常，看起來所有事情都會順利的進行下去時，突然就因為不知道哪一顆邏輯處理電路中的半導體中的矽原子突然就衰變了一樣。
照理來說一台電腦不應該只因為這種小事而關停，不過主人的邏輯思考模式其精密程度非常尋同，而且以主人的自信程度，是不可能懷疑自己的邏輯建構過程的，因此他根本沒有為這種情況做過任何預防與保險。
這種行為模式就像是計算風向與速度後，從金字塔頂落下一粒沙，讓它飄進塔下的一根縫衣針孔，而且每一小節的時間都進行一次，並持續百年以上。
然而只要其中一粒沙沒有飄進縫衣針孔，整個金字塔就會爆炸。
貓的主人兼魔術導師就這樣爆炸了。這個人從頭到尾就沒考慮過其他事情，魔術的延續，研究的繼承，這些問題從來就沒有出現在他的腦海裡過。
而他是貓在這整個阿特拉斯院中唯一敬佩過的人。
感覺在上面也待得夠久了，貓打了個哈欠，然後悠閒地漫步到中心部地下的生活區。
阿特拉斯院就像一個捕蠅草，從外面進來很簡單，但是想出去就難了，有些地方進來的時候看起來只有兩條路，但是一回頭突然發現居然是個三岔路，而且還有一些陷阱與自動人偶只會對想出去的人啟動；因此雖然不像徬徨海一樣完全拒絕外面的世界，但要知道外面發生什麼事情，還是很有難度的，不過這些魔術師天才們究竟對外面的事情有多大的興趣，也是很可疑的事情。
今天似乎有一個新的學徒被允許加入阿特拉斯院，通常也就只有這種時候，這裡才會有所謂的新聞。
「呦！」一個兩鬢看起來有些發白的青年，坐在長桌旁的板凳上對貓打著招呼，他是貓之前主人的助手，也可以算是貓的學弟；主人並有沒留下血脈，而且魔術刻印在主人死去的那瞬間就完全報廢了，這個天才在生前研究的東西可說是一點都沒有留下來，不過這倒也符合阿特拉斯院的原則：「自己的研究只對自己公開。」沒有外洩的神祕就是好神祕，畢竟魔術都是屬於過去的東西，總有一天（可能要打個問號，因為人類會滅亡，這是TRI-HERMES計算的絕對結果）還是會有人研究出主人曾經想解開的東西。
除了這個青年以外，也沒有其他人會對貓打招呼了，並不是因為他們瞧不起貓，他們連人類的彼此也不會在乎，一心只想著自己的研究；貓看到青年手臂夾著一本書，上面好像寫著一些拉丁文。
「是什麼事情啊？難得看到你的情緒這麼高昂，是實驗結果有什麼進展了嗎？」貓跳上青年旁邊的板凳，旁邊有個自動人偶馬上就滑了過來，貓對它吩咐說：「五十克雞肉沫加上等量的鯡魚醬，以及一百毫升的牛奶，分開各自裝在淺盤裡。」
自動人偶聽完又很快地滑開，青年說：「學長你沒聽說嗎？今天有個新學徒進來。」
「嗯哼？」
「他之前好像都在遠東地區活動，而他又聽說日本冬木曾經展開的那個儀式，這次不曉得為何，似乎有要在日本西南方海域的一座小島上舉行耶！」
「嗯——」貓陷入沉思。
冬木的儀式，似乎是為了打開前往根源道路的又一次嘗試，這個儀式主辦團體的核心是一個叫做愛因茲貝倫的家族，說是家族好像也不太合適，畢竟這整個家族都可以算是某個魔術師的複製人，這樣能稱為家族嗎？
儀式的目標是用第三法具現化出能夠實現任何願望、萬能的許願機，還似乎覺得事情不夠複雜似的，將這個許願機稱為「聖杯」，根本是沒事找聖堂教會那群人的麻煩吧？
能夠實現願望、前往根源的人只有一個，這個聖杯還很好心的召喚了七個英靈當作使魔給魔術師們自相殘殺，不過所謂的英靈是已經接近精靈的東西，有些傳說甚至已經達到神靈的地步，當然不可能將原來的境界紀錄帶完完整整的召喚出來，所以還煞有其事的設定了七個職階。
Saber、Lancer、Archer、Rider、Caster、Assassin，以及Berserker。
為何還要特地將各個時代的英雄召喚至現代，貓還不清楚，也只能當作儀式創始人的惡趣味了。
「時鐘塔那邊好像已經有幾個科系打算派人去調查了，不過那邊政治鬥爭有點激烈，詳細情況也很複雜。」青年雖然看見貓正在深思著，但還是自顧自地說個不停；對於阿特拉斯院的人來說，一邊做研究一邊交代事情給助手，再一邊進食一邊走路，並一邊注意路過的研究室噴出的妖魔鬼怪，一邊詠唱魔術閃躲、反擊，只是基本技能而已。
人只會對自己有興趣的東西說個不停，貓很容易就了解青年在想什麼。
「你出得去嗎？如果參加了，你有勝算嗎？」貓說。
雖然問句很短，卻切中核心；青年幾乎不可能走出這裡，就算真的出去好了，他也一定兩手空空，因為沒有人可以帶走這裡製作的東西；就算他真的什麼都不帶就出去了，也不能參加這個互相廝殺的召喚儀式，因為自己的研究成果只能對自己公開。
貓暗示著這裡每個人都不能再更清楚的原則，好像是在表明：「你該不會忘記了吧？」
青年一聽到這幾句問話，像是被讀心一般手足無措。
「被學長看出來啦……」青年有點尷尬地說：「其實我自從老師過世以後，越來越覺得自己不適合這裡，畢竟與老師相比，我很清楚自己有幾兩重，而且這裡的人們各自的研究方向都相差太多，老師也沒有留下什麼我可以繼承的東西；所以我一直都在想除了這裡，還有沒有其他的手段可以實現老師的研究。」
貓凝視著青年的表情，然後說：「你該不會真的相信有萬能的許願機這種東西存在吧？」
「這個嘛——那個東西就算不是萬能的，至少也有龐大的魔力吧？」青年說：「在我的計算當中，由愛因茲貝倫的人提供載體，再透過由瑪奇里提供的設計，如果冬木真的有如這些學徒所說的高質量靈脈，這個儀式應該是可行的。」
「你居然把珍貴的計算力用在這種地方嗎？」貓用自己的手掌扶著額頭，一邊嘆氣。
這時貓的餐點正好上來了，青年的神情看起來有些慌張。
「那個……學長您慢慢用餐，我突然想起來還有一些實驗還沒有做完，我先回去繼續研究了。」青年有點窘迫地說，貓知道他並沒有什麼特別緊急或重要的研究在進行，不過他也不是很在意，就低頭開動了。
人類並不是口頭相勸就能聽進去的生物，通常他們都需要身體力行之後付出代價，才會明白事情的道理並得到教訓，有些人甚至到死都不能醒悟；魔術師這個團體雖然異於常人，能行非人所能達成之事，但也因此特別固執，不然也就不會有那麼多魔術師糾結在過去，想要去探索那個訣別神代的人類失去的根源連結了。
人類想相信的並不是真相，而是自己想相信的東西。
之後過了幾天，貓在幾個常見到青年的地方都沒有看到他的人影。
高速的思考很快地就分析出學弟可能的去處，就算貓不想知道，他的思緒也不會自己停止思考；於是貓打開了人跡罕見的聯外大門，前往異界與現實之間的狹縫。
他在迷宮中的某個地方，看到地上有一本白底黑字、以羊皮製成的書，他用手將書翻回正面，上面用拉丁文寫著《高盧戰記》；貓的分割思考很快地就在記憶中找到與這本書相同的東西，那是夾在學弟手臂下的書。
「這麼蠢的東西，這裡應該不會有第二本吧？」貓看著書的封面，自言自語。
貓知道這個地方唯二他還在意的人都已經不見了，不過他是個魔術師，而且還是阿特拉斯院的魔術師，因此不太可能有什麼感性的反應。
不過他已經沒有理由繼續在這裡待下去了。
他發現自己正在思考著一些不該想的東西，嘴上露出一抹微笑。
絕對不能把在這裡製造的東西帶到外面去，但沒有限制製造物自行走出去吧？
雖然自己的研究成果只能對自己公開，但只要知道了自己魔術的人都消失了的話，就沒有問題了吧？
看來事情就是這樣了，既然已經下了決定，貓將書本收到異次空間中，往三岔路的中間那條前進。
他看到他們兩人的故事與歸屬，現在他想知道自己的。